Le dernier complot diabolique du Dr Phibes est d'enlever trois des plus grands scientifiques du monde afin d'acquérir des armes technologiquement avancées. Shaggy et Scooby doivent empêcher cela en se faufilant dans le country club où les scientifiques sont honorés et les protéger à tout prix, tout en traitant avec les agents de Phibes.